Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1071400 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1071400
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Lentilactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 "Bacterium buchneri" (Henneberg 1903) Henneberg 1926
🌍 Secondary gas eye formation and histamine accumulation NSLAB agent ; Agent lactique d'ouverture gazeuse secondaire et d'accumulation d'histamine
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 7 linked cheese matrix/matrices • 🧊 9 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Lactobacillaceae (family)
› Lentilactobacillus (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (7) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Emmental, Gruyère, Comté, Gouda, Cheddar vieux)
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Lentilactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 ⟷ Lactobacillus buchneri CD034 • Lactobacillus buchneri strain CD034 • Lactobacillus buchneri str. CD034 • Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Secondary gas eye formation and histamine accumulation NSLAB agent ; Agent lactique d'ouverture gazeuse secondaire et d'accumulation d'histamine • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Bacterium buchneri" (Henneberg 1903) Henneberg 1926 |
| Official sources & reference book | TaxID:1071400 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:18456715 🔎 • DOI:10.3168/jds.2007-0828 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent lactique d'ouverture gazeuse secondaire et d'accumulation d'histamine • Goût piquant et poivré lié à l'histamine, odeur acétique piquante, apparition d'yeux secondaires tardifs ou de gerces dans la pâte • Provolone [en:provolone], Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Caciocavallo [en:caciocavallo], Provolone del monaco [it:provolone-del-monaco], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Asiago [en:asiago] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Conversion anaérobie de l'acide lactique en acide acétique, 1,2-propanediol et CO2, et décarboxylation de la L-histidine en histamine (enzyme HDC) |
| Documented substrates & historical synonyms | Maîtrise de la qualité des ensilages et de l'hygiène de traite, contrôle de la température des caves de garde, sélection de flores d'affinage HDC-négatives • Contamination par l'ensilage d'herbe ou de maïs, survie à la thermisation, protéolyse poussée libérant de l'histidine libre, T° cave > 12 °C |
| Official sources & reference book | TaxID:1071400 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 20057, ATCC 4005, NCIMB 8007, CIP 103023 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:18456715 🔎 • DOI:10.3168/jds.2007-0828 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (8 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (28 éch.) • Secondary gas eye formation and histamine accumulation NSLAB agent ; Agent lactique d'ouverture gazeuse secondaire et d'accumulation d'histamine • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Emmental, Gruyère, Comté, Gouda, Cheddar vieux) • Asiago [en:asiago], Montasio [it:montasio], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Provolone del monaco [it:provolone-del-monaco], Provolone [en:provolone], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Montasio (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Parmigiano Reggiano (EST 77.4 %, MNA 31.3 %, NaCl 4.57 g/100g) ; Caciocavallo Silano (EST 20.2 %, MNA 83.39 %, NaCl 0.8 g/100g) • "Bacterium buchneri" (Henneberg 1903) Henneberg 1926 • Lactobacillus buchneri CD034 • Lactobacillus buchneri strain CD034 • Lactobacillus buchneri str. CD034 • Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 |
| Official sources & reference book | TaxID:1071400 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:18456715 🔎 • DOI:10.3168/jds.2007-0828 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Lactobacillus buchneri CD034 • Lactobacillus buchneri strain CD034 • Lactobacillus buchneri str. CD034 • Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #4YSN (9 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000298115.2 • Taille: 2.56317 Mb • GC: 44.2381 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN02603054 • BioProject: PRJNA71051 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:18456715 🔎 • DOI:10.3168/jds.2007-0828 🔎 |