Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #246432 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #246432
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Staphylococcus equorum Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013
⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 26 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 7 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Staphylococcaceae (family)
› Staphylococcus (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (26) :
🧀 Asiago
🧀 Blue cheese
🧀 Caciocavallo
🧀 Caciotta
🧀 Cheddars
🧀 Feta
🧀 Fontal
🧀 Fontina
🧀 Fromages à pâte pressée cuite
🧀 Gamoneu
🧀 Gorgonzolas
🧀 Gruyère
🧀 Montasio
🧀 Parmigiano Reggiano
🧀 Pecorino
🧀 Pecorino toscano
🧀 Picon bejes tresviso
🧀 Pied-De-Vent
🧀 Provolone
🧀 Provolone del monaco
🧀 Queso palmero
🧀 Raclettes
🧀 Roqueforts
🧀 Stilton cheese
🧀 Tommes
🧀 Valtellina casera
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Stilton cheese [en:stilton-cheese], Pied-De-Vent [qc:pied-de-vent], Gruyère [fr:gruyere], Provolone [en:provolone], Valtellina casera [it:valtellina-casera], Pecorino [en:pecorino], Fontina [en:fontina], Provolone del monaco [it:provolone-del-monaco] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Formation de la croûte naturelle subéreuse brun-orangé après le lissage (rubbing up) du cylindre ; Coque halotolérant adapté à l'air marin des Îles-de-la-Madeleine stabilisant la flore de croûte du Pied-De-Vent ; Sous-espèce halotolérante dominante des morges de pâtes pressées cuites suisses (souche Mu2 TaxID:1159488) • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_016127455.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 2.77232 Mb • GC: 33.0594 % • Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Staphylococcus equorum (Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas] • Grèce ; Italie ; Espagne — Onís ; Suisse ; France — Roquefort-sur-Soulzon |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Gamoneu (EST 10.9 %, G/S 2.48 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages de Grèce ; Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages espagnols ; Fromages à pâte persillée français • Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Gamoneu (EST 10.9 %, G/S 2.48 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Feta (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Gamoneu (Appellation d'origine protégée) |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Feta (EST 44.8 %, MNA 70.32 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Gamoneu (EST 10.9 %, MNA 89.34 %, NaCl 1.2 g/100g) • Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #09 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Interactomes et syntrophie des surfaces
🔎 Preuve SQLite
| Partenaires microbiens de consortium & matrices | Acidipropionibacterium acidipropionici (TaxID:1748) ; Acidipropionibacterium jensenii (TaxID:1749) ; Acidovorax facilis (TaxID:12917) ; Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Acinetobacter baumannii (TaxID:470) ; Acinetobacter johnsonii (TaxID:40214) ; Acinetobacter junii (TaxID:40215) ; Aeromonas caviae (TaxID:648) • Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette] |
|---|---|
| Cofacteurs vitaminiques B1–B12 (USDA) & pigments | Folic acid : 0 µg ; Vitamin E (alpha-tocopherol) : 0.18 mg ; Lutein + zeaxanthin : 0 µg ; Carotene, beta : 3 µg ; Carotene, alpha : 0 µg |
| Typologie des croûtes & succession d'affinage | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas] • Grèce ; Italie ; Espagne — Onís ; Suisse ; France — Roquefort-sur-Soulzon |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Feta (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Gamoneu (Appellation d'origine protégée) ; Montasio (Appellation d'origine protégée) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | Staphylococcus equorum Schleifer et al. 1985 emend. Jeong et al. 2013 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | SAMN23026963 • PRJNA764004 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Volatilome et profils aromatiques
🔎 Preuve SQLite
| Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils | trimethylamine ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; palmitic acid ; oleic acid ; octanoic acid • Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette] |
|---|---|
| Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) | Cholestérol : 89 mg ; Fatty acids, total saturated : 13.3 g ; SFA 16:0 : 4.75 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.62 g ; Glutamic acid : 2.42 g ; Leucine : 1.4 g ; Proline : 1.38 g • Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Accords gastronomiques & affinités sensorielles | Baby Spinach ; Cucumber |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #12 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Gestes de l'affineur et soins de cave
🔎 Preuve SQLite
| Conduite de croûte, soins de cave & matrices | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Feta [en:feta], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Montasio [it:montasio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas] |
|---|---|
| Équilibre hydrique, extrait sec & salage (USDA) | Feta (EST 44.8 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Gamoneu (EST 10.9 %, NaCl 1.2 g/100g) • Bacteria |
| Caves d'affinage, fromageries & régions | Grèce ; Italie ; Espagne — Onís ; Suisse ; France — Roquefort-sur-Soulzon |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:246432 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (4) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #5X2J (7 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_016127455.1 • Taille: 2.77232 Mb • GC: 33.0594 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23026963 • BioProject: PRJNA764004 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=368)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fontina (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:tomme-cheese-from-cow-s-milk (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:provolone (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:hard-cheeses (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:montasio (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:feta (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheddar-cheese (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:valtellina-casera (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:provolone-del-monaco (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fontal (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:pecorino-toscano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:gorgonzolas (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:caciotta (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:raclette (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:parmigiano-reggiano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:picon-bejes-tresviso (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:gamoneu (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:queso-palmero (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:roquefort-cheeses (n=2)