Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1359 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1359
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Lactococcus cremoris Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021
⚡ 9 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 41 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Streptococcaceae (family)
› Lactococcus (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (41) :
🧀 Asiago
🧀 Bleu bénédictin
🧀 Blue cheese
🧀 Brie de Meaux cheeses
🧀 Bries
🧀 Caciocavallo
🧀 Caciotta
🧀 Castelmagno
🧀 Cheddar cheese
🧀 Cheddar cheese
🧀 Cheese core
🧀 Danablu
🧀 Edam
🧀 Fiore sardo
🧀 Fourme d'Ambert cheese from cow's milk
🧀 Fromage en grains
🧀 Fresh cheeses
🧀 Hard cheeses
🧀 Uncooked pressed cheeses
🧀 Gouda
🧀 Idiazabal
🧀 Kefir
🧀 Whey
🧀 Le Riopelle de l'Isle
🧀 Livarot
🧀 Monte veronese
🧀 Noord hollandse gouda
🧀 Paillasson de l'Isle d'Orléans
🧀 Pecorino
🧀 Pecorino toscano
🧀 Pont-l'évêque
🧀 Pouligny-Saint-Pierre
🧀 Provolone
🧀 Provolone del monaco
🧀 Tetilla cheese
🧀 Queso de murcia
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core
Palier 1
Master index of cheese starters and ripening cultures
🔎 SQLite Proof
| Associated dairy & cheese matrices | Fourme d'Ambert [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Brie de Meaux [en:brie-de-meaux-cheeses], Goudas [en:gouda], Cheddars [en:cheddar-cheese], Le Riopelle de l'Isle [qc:le-riopelle-de-l-isle], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin], Paillasson de l'Isle d'Orléans [qc:paillasson-de-l-isle-d-orleans], Fromage en grains [qc:fromage-en-grains] |
|---|---|
| Paste typology & technological evidence | Acidification mésophile douce évitant la post-acidification et préservant le moelleux de la pâte ; Acidification mésophile équilibrée du lait cru emprésuré dominant avant le moulage à la pelle à brie ; Composant majeur du levain mésophile LD ou L assurant une acidification nette sans amertume après le délactosage à l'eau chaude • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Secondary metabolites & reference collections | GCA_000468955.1 |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Matrix TDM % & FDM % | Taille: 2.42705 Mb • GC: 35.7 % • Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021 |
| Predatory bacteriophages & PubMed literature | Phages: Ceduovirus sp. '50501', Lactococcus phage 10W24, Lactococcus phage 11W16L, Lactococcus phage 340, Lactococcus phage 3R07S, Lactococcus phage 5171F |
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Lactococcus cremoris ⟷ Lactococcus lactis subsp. cremoris • Streptococcus cremoris • Streptococcus hollandicus • Streptococcus lactis B • Streptococcus lactis subsp. cremoris |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021 |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
INDEX-EXPERT™ #02 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Ecological origins and habitats
🔎 SQLite Proof
| Cheese biotope, terroirs & isolation substrates | Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Castelmagno [it:castelmagno], Queso Tetilla / Tetilla cheese [en:tetilla-cheese] • Italie ; Danemark ; France — Calvados — Eure ; France — Côte-d'Or — Yonne ; Espagne — Alava — Guipuscoa |
|---|---|
| Deposited strains & reference collections | Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
| Colonized matrix TDM % & FDM % | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Époisses (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #03 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Paste textures and rheology
🔎 SQLite Proof
| Paste/rind typology & linked matrices | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo] • Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
|---|---|
| Proteolytic profile, amino acids (USDA) & metabolites | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Dry matter (TDM %), FDM %, Ca/P ratio & mineralization | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Époisses (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Guide clinique de la rhéologie fromagère et des matrices coagulées (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Cheese families and technologies
🔎 SQLite Proof
| Technological family & associated appellations | Fromages italiens ; Fromages à pâte persillée ; Danish cheeses ; Fromages de vache ; Fromages de France • Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Castelmagno [it:castelmagno], Queso Tetilla / Tetilla cheese [en:tetilla-cheese] |
|---|---|
| Paste/rind diagram & technological function | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Époisses (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies | Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Danablu (indications géographiques protégées de l'Union européenne) ; Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Époisses (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) |
INDEX-EXPERT™ #05 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Technological markers (pH and gas)
🔎 SQLite Proof
| Carbohydrate substrates, residual lactose (USDA) & metabolites | Protein : 7.96 g ; Ash : 1.63 g ; Lactose : 1.91 g ; Fiber, total dietary : 1.4 g • Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo] |
|---|---|
| Metabolic role & characterized compounds | Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Draining, moisture, salting (USDA) & linked matrices | Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Danablu (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Livarot (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Époisses (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) • Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo] |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Vat phage monitoring & PubMed references | Phages: Ceduovirus sp. '50501' (TaxID:3403659), Lactococcus phage 10W24 (TaxID:1874570), Lactococcus phage 11W16L (TaxID:1874571), Lactococcus phage 340 (TaxID:1262533), Lactococcus phage 3R07S (TaxID:1874580) |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Castelmagno [it:castelmagno], Queso Tetilla / Tetilla cheese [en:tetilla-cheese] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Danablu (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Livarot (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Époisses (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) • Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021 • Lactococcus lactis subsp. cremoris • Streptococcus cremoris • Streptococcus hollandicus • Streptococcus lactis B • Streptococcus lactis subsp. cremoris |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #10 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Terroirs and protected designations (PDO/PGI)
🔎 SQLite Proof
| Linked cheeses & dairy basins of origin | Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Castelmagno [it:castelmagno], Queso Tetilla / Tetilla cheese [en:tetilla-cheese] • Italie ; Danemark ; France — Calvados — Eure ; France — Côte-d'Or — Yonne ; Espagne — Alava — Guipuscoa |
|---|---|
| Official designations (PDO/PGI) & rinds | Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Danablu (indications géographiques protégées de l'Union européenne) ; Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Époisses (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Idiazabal (Appellation d'origine protégée) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Terroir cheesemakers & official awards | Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021 |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Reference collections, BioSample & BioProject | SAMEA114062885 • PRJEB62820 |
INDEX-EXPERT™ #14 • Tyrodexia™ Milk Science & Health
Palier 4
Bioactive peptidome, functional health and clinical vigilance
🔎 SQLite Proof
| Cardioprotective vitamins (USDA) & bioactives | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg |
|---|---|
| Functional amino acids (GABA, Proline USDA) | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g ; Lysine : 0.598 g ; Serine : 0.46 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Bioactive fatty acids (CLA, Omega-3) & minerals | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg • Asiago [en:asiago], Danablu [da:danablu], Livarot [en:livarot], Époisses / Époisses de Bourgogne [en:epoisses-de-bourgogne], Idiazabal [es:idiazabal], Fiore sardo [it:fiore-sardo] |
| Actual lactose extinction & sugars (USDA) | Fiber, total dietary : 1.4 g ; Total lipid (fat) : 6 g ; Carbohydrate, by difference : 17.6 g ; Énergie : 156 kcal ; Glucose : 1.18 g |
| Reference collections, authority & synonyms | Lactococcus cremoris (Orla-Jensen 1919) Li et al. 2021 • Lactococcus lactis subsp. cremoris • Streptococcus cremoris • Streptococcus hollandicus • Streptococcus lactis B • Streptococcus lactis subsp. cremoris |
| Official sources & reference book | TaxID:1359 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Lactococcus lactis subsp. cremoris • Streptococcus cremoris • Streptococcus hollandicus • Streptococcus lactis B • Streptococcus lactis subsp. cremoris |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (18) :
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris
#2816960
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris A76
#1104322
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris GE214
#1415168
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris HP
#1295827
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris IBB477
#1449093
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris KW2
#1295826
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris MG1363
#416870
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris NBRC 100676
#1348655
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris NZ9000
#746361
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris SK11
#272622
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris TIFN1
#1234871
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris TIFN3
#1234873
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris TIFN5
#1234875
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris TIFN6
#1234876
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris TIFN7
#1234877
🦠 Lactococcus cremoris subsp. cremoris UC509.9
#1111678
🦠 Lactococcus cremoris subsp. sagaensis
#3816587
🦠 Lactococcus cremoris subsp. tructae
#542833
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1PJI (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000468955.1 • Taille: 2.42705 Mb • GC: 35.7 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA114062885 • BioProject: PRJEB62820 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=588)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:kefir (n=210)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:whey (n=38)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheddar-cheese (n=20)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:caciotta (n=16)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=14)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=10)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:fiore-sardo (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:bries (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fresh-cheeses (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheese-core (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:pecorino-toscano (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:edam (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:tomme-cheese-from-cow-s-milk (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:castelmagno (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:provolone-del-monaco (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:monte-veronese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:provolone (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:hard-cheeses (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:red-leicester (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:sainte-maure-de-touraine (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pouligny-saint-pierre (n=2)