Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1358 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1358
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Lactococcus lactis Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980)
⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 106 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Streptococcaceae (family)
› Lactococcus (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (106) :
🧀 1608
🧀 Asiago
🧀 Bleu d'Élizabeth
🧀 Blue cheese
🧀 Bonne Bouche
🧀 Brie de Melun
🧀 Bries
🧀 Caciocavallo
🧀 Caciocavallo Silano
🧀 Camemberts
🧀 Camemberts
🧀 Cantal
🧀 Cendrillon
🧀 Chaource
🧀 Chaource
🧀 Cheddars
🧀 Cheddars
🧀 Cheese core
🧀 Chemin Hatley
🧀 Chèvre à ma manière
🧀 Crottins de Chavignol
🧀 Danablu
🧀 Feta
🧀 Fiore sardo
🧀 Fontina
🧀 Fromage en grains
🧀 Fromages de brebis
🧀 Fromages de chèvre
🧀 Fromages à pâte fraîche
🧀 Fromages à pâte molle à croûte fleurie
🧀 Fromages à pâte persillée
🧀 Fromages à pâte pressée cuite
🧀 Fromages à pâte pressée non cuite
🧀 Goudas
🧀 Kéfir
🧀 La Madelaine
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Roqueforts [en:roquefort-cheeses], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Camemberts [en:camemberts], Brie de Melun [en:brie-de-melun], Chaource [en:chaource], Neufchâtel [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk], Munsters [en:munster], Époisses [en:epoisses-de-bourgogne] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Acidification mésophile du lait cru de brebis Lacaune et égouttage spontané sans pressage ; Acidification mésophile lente sur 18 heures donnant la texture beurrée et friable typique du Stilton ; Acidification lactique mésophile du lait cru normand moulé en 5 passages à la louche avec repos de 40 minutes • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_003176835.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 2.63908 Mb • GC: 34.9706 % • Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980) |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | Phages: Ceduovirus sp. '56006', Lactococcus lactis phage 645, Lactococcus lactis phage P113G, Lactococcus lactis phage p272, Lactococcus lactis phage P475, Lactococcus phage 05601 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Lactococcus lactis ⟷ Lactobacillus xylosus • Streptococcus lactis (Lister 1873) Lohnis 1909 (Approved Lists 1980) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Danablu [da:danablu], Montasio [it:montasio] • Italie ; Grèce ; France — Cantal — Puy-de-Dôme ; Danemark ; France — Doubs — Ain |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Acidification mésophile de la pâte demi-ferme souple parsemée de petites ouvertures mécaniques ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Acidification primaire du lait de brebis de la Ferme Phyluma / Fromagerie du Presbytère |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #03 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Textures de pâte et rhéologie
🔎 Preuve SQLite
| Typologie de pâte/croûte & matrices reliées | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina] • Acidification mésophile de la pâte demi-ferme souple parsemée de petites ouvertures mécaniques ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Acidification primaire du lait de brebis de la Ferme Phyluma / Fromagerie du Presbytère |
|---|---|
| Profil protéolytique, acides aminés (USDA) & métabolites | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Extrait sec (EST %), G/S %, ratio Ca/P & minéralisation | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Guide clinique de la rhéologie fromagère et des matrices coagulées (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages italiens ; Fromages de Grèce ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée non cuite • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Danablu [da:danablu], Montasio [it:montasio] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Acidification mésophile de la pâte demi-ferme souple parsemée de petites ouvertures mécaniques ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Acidification primaire du lait de brebis de la Ferme Phyluma / Fromagerie du Presbytère • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Feta (Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) |
INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Marqueurs technologiques (pH et gaz)
🔎 Preuve SQLite
| Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites | Protein : 7.96 g ; Ash : 1.63 g ; Lactose : 1.91 g ; Fiber, total dietary : 1.4 g • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina] |
|---|---|
| Rôle métabolique & composés caractérisés | Acidification mésophile de la pâte demi-ferme souple parsemée de petites ouvertures mécaniques ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Acidification primaire du lait de brebis de la Ferme Phyluma / Fromagerie du Presbytère • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées | Oka (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Feta (EST 44.8 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina] |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Surveillance phagique en cuve & références PubMed | Phages: Ceduovirus sp. '56006' (TaxID:3403660), Lactococcus lactis phage 645 (TaxID:270182), Lactococcus lactis phage P113G (TaxID:213773), Lactococcus lactis phage P475 (TaxID:213774), Lactococcus lactis phage p272 (TaxID:213777) |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Acidification mésophile de la pâte demi-ferme souple parsemée de petites ouvertures mécaniques ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Acidification primaire du lait de brebis de la Ferme Phyluma / Fromagerie du Presbytère • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Danablu [da:danablu], Montasio [it:montasio] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Oka (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Feta (EST 44.8 %, MNA 70.32 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980) • Lactobacillus xylosus • Streptococcus lactis (Lister 1873) Lohnis 1909 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Danablu [da:danablu], Montasio [it:montasio] • Italie ; Grèce ; France — Cantal — Puy-de-Dôme ; Danemark ; France — Doubs — Ain |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Feta (Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Salers (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | PRJNA674949 |
INDEX-EXPERT™ #14 • Science du lait & santé Tyrodexia™
Palier 4
Peptidome bioactif, santé fonctionnelle et vigilance clinique
🔎 Preuve SQLite
| Vitamines cardioprotectrices (USDA) & bioactifs | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg |
|---|---|
| Acides aminés fonctionnels (GABA, Proline USDA) | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g ; Lysine : 0.598 g ; Serine : 0.46 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Streptococcaceae (family) › Lactococcus (genus) |
| Acides gras bioactifs (ALC, Oméga-3) & minéraux | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Feta [en:feta], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina] |
| Extinction réelle du lactose & sucres (USDA) | Fiber, total dietary : 1.4 g ; Total lipid (fat) : 6 g ; Carbohydrate, by difference : 17.6 g ; Énergie : 156 kcal ; Glucose : 1.18 g |
| Collections de référence, autorité & synonymes | Lactobacillus xylosus Kitahara 1938 (Approved Lists 1980) • Lactobacillus xylosus • Streptococcus lactis (Lister 1873) Lohnis 1909 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1358 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Lactobacillus xylosus • Streptococcus lactis (Lister 1873) Lohnis 1909 (Approved Lists 1980) |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (22) :
🦠 Lactococcus lactis (ex Latorre-Guzman et al. 1977) Schleifer et al. 1986
#2731284
🦠 Lactococcus lactis RTB018
#1408188
🦠 Lactococcus lactis subsp. hordniae
#203404
🦠 Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931
#1348656
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis
#1360
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis 1AA59
#1379274
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis A12
#1137134
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis CNCM I-1631
#1042402
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis CV56
#929102
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis Dephy 1
#1390360
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1
#1046624
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403
#272623
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis JCM 5805 = NBRC 100933
#1236944
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis JCM 7638
#1291762
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis KF147
#684738
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325
#1399116
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118
#1117941
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis YF11
#1149132
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis
#44688
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis str. LD61
#1408260
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis str. TIFN2
#1234601
🦠 Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis str. TIFN4
#1283280
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1DOR (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_003176835.1 • Taille: 2.63908 Mb • GC: 34.9706 % • Statut: Complete Genome • BioProject: PRJNA674949 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=868)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:kefir (n=324)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheddar-cheese (n=166)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:whey (n=58)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo (n=54)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=38)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=30)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheese-core (n=28)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:mozzarella (n=20)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=18)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:caciotta (n=18)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:tomme-cheese-from-cow-s-milk (n=18)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:provolone (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:parmigiano-reggiano (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:maasdam (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:bries (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:fiore-sardo (n=10)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fresh-cheeses (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:yogurts (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:montasio (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:pecorino-sardo (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:pecorino-toscano (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:castelmagno (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:feta (n=4)