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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1597 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1597

Lacticaseibacillus paracasei Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020

⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 50 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 13 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)

🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (50) :

🧀 Asiago 🧀 Asiago 🧀 Beaufort 🧀 Bitto 🧀 Blue cheese 🧀 Caciocavallo 🧀 Caciocavallo Silano 🧀 Caciotta 🧀 Castelmagno 🧀 Cheddars 🧀 Cheese core 🧀 Comté 🧀 Feta 🧀 Fiore sardo 🧀 Fontina 🧀 Fromages à pâte fraîche 🧀 Fromages à pâte pressée non cuite 🧀 Gamoneu 🧀 Goudas 🧀 Grana Padano 🧀 Idiazabal 🧀 Labne 🧀 Lactosérum 🧀 Langres 🧀 Livarot 🧀 Louis Cyr 🧀 Manchego 🧀 Montasio 🧀 Monte veronese 🧀 Morbiers 🧀 Ossau-Iraty 🧀 Parmigiano Reggiano 🧀 Parmigiano Reggiano 🧀 Pecorino 🧀 Pecorino sardo 🧀 Picon bejes tresviso

INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

🔎 Preuve SQLite

Matrices fromagères & substrats associés	Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Salers [en:salers-cheese], Manchego [en:manchego], Asiago [en:asiago], Goudas [en:gouda], Zacharie Cloutier [qc:zacharie-cloutier], Louis Cyr [qc:louis-cyr], Taliah [qc:taliah]
Typologie de pâte & preuves technologiques	Peptidolyse intracellulaire après autolyse des ferments primaires et synthèse d'esters fruités caractéristiques ; Bactérie du biofilm de la gerle en bois de chêne ou de châtaignier assurant la typicité aromatique de chaque buron ou ferme ; Flore NSLAB dominante des Manchego Artesano au lait cru gouvernant la protéolyse et la lipolyse des triglycérides ovins sur 3 à 12 mois • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Métabolites secondaires & collections de référence	GCA_000155515.2
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
EST %, G/S % des matrices fromagères	Taille: 3.02535 Mb • GC: 46.3035 % • Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed	Phages: Lacticaseibacillus phage P2.4, Lacticaseibacillus phage P7.1, Lactobacillus phage CL1, Lactobacillus phage CL2, Lactobacillus phage iA2, Lactobacillus phage iLp1308

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Lacticaseibacillus paracasei ⟷ Lactobacillus casei subsp. alactosus • Lactobacillus casei subsp. pseudoplantarum • Lactobacillus paracasei
Synonymes & basionymes historiques	Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)

INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Origines et habitacles écologiques

🔎 Preuve SQLite

Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement	Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Livarot [en:livarot] • Grèce ; Italie ; France — Franche-Comté ; Espagne — Onís ; France — Calvados — Eure
Souches déposées & collections de référence	Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Maturation sur 9 à 12 mois de cette pâte ferme de brebis inspirée du Pecorino et du Manchego ; Microbiote fromager caractérisé (20 éch.)
EST %, G/S % des matrices colonisées	Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Bitto (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Comté (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)

INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite

Famille technologique & appellations associées	Fromages de Grèce ; Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée cuite • Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Livarot [en:livarot]
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique	Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Maturation sur 9 à 12 mois de cette pâte ferme de brebis inspirée du Pecorino et du Manchego ; Microbiote fromager caractérisé (20 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices	Feta (EST 44.8 %, G/S 47.99 %) ; Bitto (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Comté (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed	Feta (Appellation d'origine protégée) ; Bitto (Appellation d'origine protégée) ; Comté (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée)

INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Marqueurs technologiques (pH et gaz)

🔎 Preuve SQLite

Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites	Total Sugars : 0 g ; Total lipid (fat) : 21.5 g ; Carbohydrate, by difference : 3.88 g ; Énergie : 265 kcal • Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina]
Rôle métabolique & composés caractérisés	Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Maturation sur 9 à 12 mois de cette pâte ferme de brebis inspirée du Pecorino et du Manchego ; Microbiote fromager caractérisé (20 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées	Feta (EST 44.8 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Bitto (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina]
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Surveillance phagique en cuve & références PubMed	Phages: Lacticaseibacillus phage P2.4 (TaxID:3016939), Lacticaseibacillus phage P7.1 (TaxID:3016940), Lactobacillus phage CL1 (TaxID:1739607), Lactobacillus phage CL2 (TaxID:1739608), Lactobacillus phage J-1 (TaxID:1414736)

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Maturation sur 9 à 12 mois de cette pâte ferme de brebis inspirée du Pecorino et du Manchego ; Microbiote fromager caractérisé (20 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Livarot [en:livarot] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	Feta (EST 44.8 %, MNA 70.32 %, NaCl 2.9 g/100g) ; Bitto (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020 • Lactobacillus casei subsp. alactosus • Lactobacillus casei subsp. pseudoplantarum • Lactobacillus paracasei
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)

INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Terroirs et appellations protégées

🔎 Preuve SQLite

Fromages reliés & bassins laitiers d'origine	Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Gamoneu [es:gamoneu], Livarot [en:livarot] • Grèce ; Italie ; France — Franche-Comté ; Espagne — Onís ; France — Calvados — Eure
Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes	Feta (Appellation d'origine protégée) ; Bitto (Appellation d'origine protégée) ; Comté (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Fromageries de terroir & palmarès officiels	Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Collections de référence, BioSample & BioProject	SAMN23027407 • PRJNA764004

INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Volatilome et profils aromatiques

🔎 Preuve SQLite

Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils	trimethylamine ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; oleic acid ; octanoic acid ; methanethiol • Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina]
Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA)	Cholestérol : 89 mg ; Fatty acids, total saturated : 13.3 g ; SFA 16:0 : 4.75 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.62 g ; Glutamic acid : 2.42 g ; Leucine : 1.4 g ; Proline : 1.38 g • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Maturation sur 9 à 12 mois de cette pâte ferme de brebis inspirée du Pecorino et du Manchego ; Microbiote fromager caractérisé (20 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Accords gastronomiques & affinités sensorielles	Baby Spinach ; Cucumber • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.)
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)

INDEX-EXPERT™ #14 • Science du lait & santé Tyrodexia™ Palier 4

Peptidome bioactif, santé fonctionnelle et vigilance clinique

🔎 Preuve SQLite

Vitamines cardioprotectrices (USDA) & bioactifs	Folic acid : 0 µg ; Vitamin E (alpha-tocopherol) : 0.18 mg ; Lutein + zeaxanthin : 0 µg ; Carotene, beta : 3 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg
Acides aminés fonctionnels (GABA, Proline USDA)	Glutamic acid : 2.42 g ; Leucine : 1.4 g ; Proline : 1.38 g ; Lysine : 1.22 g ; Serine : 1.17 g ; Valine : 1.06 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lacticaseibacillus (genus)
Acides gras bioactifs (ALC, Oméga-3) & minéraux	Cholestérol : 89 mg ; Fatty acids, total saturated : 13.3 g ; SFA 16:0 : 4.75 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.62 g ; Sodium, Na : 1140 mg ; Calcium, Ca : 493 mg ; Potassium, K : 62 mg ; Zinc, Zn : 2.88 mg • Feta [en:feta], Bitto [it:bitto], Comté [en:comte], Taliah [qc:taliah], Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina]
Extinction réelle du lactose & sucres (USDA)	Énergie : 265 kcal ; Eau : 55.2 g ; Protein : 14.2 g ; Ash : 5.2 g ; Fiber, total dietary : 0 g
Collections de référence, autorité & synonymes	Lacticaseibacillus paracasei (Collins et al. 1989) Zheng et al. 2020 • Lactobacillus casei subsp. alactosus • Lactobacillus casei subsp. pseudoplantarum • Lactobacillus paracasei
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1597 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Lactobacillus casei subsp. alactosus • Lactobacillus casei subsp. pseudoplantarum • Lactobacillus paracasei

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (45) :

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #2QL8 (13 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_000155515.2 • Taille: 3.02535 Mb • GC: 46.3035 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23027407 • BioProject: PRJNA764004

📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :

Organisme d'autorité
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Table relationnelle SQLite
Clé primaire officielle